大東 信仁（ものくろ） まもなく（2016年9月21日）にリリースされる macOS 10.12 Sierra では、キーボード周りの仕様変更があり、キーボード配列を変更するアプリ karabiner が動作しなくなります。Karabinerの作者さんが、変更に対応する新アプリを開発中ですが、残り日数が迫ってきているのも事実です。
NICOLA配列なら
orzレイアウトを利用する（karabinerを使う）場合は、アップデート行わないでください。
ただし、NICOLA配列の場合は、macOS 10.12 Sierra でも、親指シフトタイピングをエミュレートしてくれて、動作するのがこちらのアプリです。
Lacaille
ただし、こちらのアプリでは、orzレイアウトを利用することが現状では難しいです。英字入力中のキーボードレイアウトを変更する方法が見当たらないからです。
（修正・追記 2016/09/21: 作者さんへお願いしたところ、素早くご対応・アップデートしていただきました。感謝。）
Lacailleバージョン2.1を導入されることで、対策可能です。
（Karabinerにて、orzレイアウトを利用されたい場合は、macOS 10.12 Sierra へのアップデートは行わないようにお願いします。）
対応しました。
追記:2016年9月21日
orzレイアウト定義ファイル作成し公開しました。英字を入力もorzレイアウトです。
ScanSnapもトラブルが起きる
なお、親指シフトとは関係ないのですが、スキャナーのScanSnapも、macOS 10.12 Sierra にアップデートすると、トラブルが発生することがアナウンスされています。
